RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FANCD2OSQ96PS1 177 aa16.29■□□□□ 0.2
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0U1RQV1 116 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G5P39877 138 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA1O15239 70 aa16.29■□□□□ 0.2
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM236CP0DP71 79 aa16.28■□□□□ 0.2
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PTPRM-211ENST00000580170 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.28■□□□□ 0.2
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PTPRM-211ENST00000580170 C20orf197Q8N268 126 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf22Q8N5N4 141 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 PROP1O75360 226 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRM-211ENST00000580170 NFE4Q86UQ8 179 aa16.27■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM89A2RUT3 159 aa16.26■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.26■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 WISP2O76076 250 aa16.26■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 SPRY4Q9C004 299 aa16.25■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 OBSL1O75147 1896 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa16.25■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0J9YX75 114 aa16.25■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRM-211ENST00000580170 CXCL5P42830 114 aa16.24■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 MED13Q9UHV7 2174 aa16.22■□□□□ 0.19
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PTPRM-211ENST00000580170 PDE6GP18545 87 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRM-211ENST00000580170 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.18■□□□□ 0.18
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRM-211ENST00000580170 ODF3BA8MYP8 253 aa16.17■□□□□ 0.18
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PTPRM-211ENST00000580170 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.15■□□□□ 0.18
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PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA7O95182 113 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 PRO0255Q9UI72 69 aa16.12■□□□□ 0.17
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PTPRM-211ENST00000580170 Q8NA96 180 aa16.12■□□□□ 0.17
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PTPRM-211ENST00000580170 BPY2O14599 106 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 COX7BP24311 80 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC11Q8NEX6 87 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf173Q96LM9 149 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa16.09■□□□□ 0.17
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