RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRSQ13332 1948 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 hDV103S1A0JD37 113 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM223A0PJW6 202 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 F8WEM9 126 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-34P06331 123 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 NOVP48745 357 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf83Q53S99 150 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 Q8N6K4 173 aa2.12□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 Q8N7P7 452 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF414Q96IQ9 312 aa2.12□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 PKD1L2Q7Z442 2459 aa2.11□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 K7ERS5 55 aa2.11□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 C15orf32Q32M92 178 aa2.11□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 CASC10Q5T4H9 136 aa2.11□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF815PA8K554 130 aa2.1□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZRP5 223 aa2.1□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 PRAC1Q96KF2 57 aa2.1□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 A6NED7 52 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.09□□□□□ -2.07
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PTPRM-204ENST00000577468 SRRM5B3KS81 715 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 E7EUB6 86 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV1-51P01701 117 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 CGB3P0DN86 165 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 CGB7P0DN87 165 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 LUZP6Q538Z0 58 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.09□□□□□ -2.07
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