RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 DUX3Q96PT4 197 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 KNCNA6PVL3 124 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBX1P62877 108 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 ZNF479Q96JC4 524 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 IGLL5B9A064 214 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 KRTAP10-9P60411 292 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RRN3P1Q2M238 152 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 LEPROTO15243 131 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 DEFB136Q30KP8 78 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 VCX2Q9H322 139 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 TACC2O95359 2948 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 K7ERJ3 54 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 Q6ZSV7 163 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 LINC01587Q99440 93 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 PTPN13Q12923 2485 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 A0A0J9YY99 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 TMEM223A0PJW6 202 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 F8W1H4 67 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 J3QQQ9 107 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 J3QR89 54 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RS1O15537 224 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 CD28P10747 220 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 FHL3Q13643 280 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 STHQ8IWL8 128 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 VPS25Q9BRG1 176 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 IGHV3-53P01767 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 P0DMU3 169 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 FAM231AP0DMU4 169 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 FAM231CP0DMU5 169 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 UBE2D1P51668 147 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 RNF151Q2KHN1 245 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 AMELXQ99217 191 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-205ENST00000546891 MUC4Q99102 2169 aa7.15□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TMEM238C9JI98 176 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CCL24O00175 119 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CR1P17927 2039 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 C16orf95Q9H693 158 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CIDEAO60543 219 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 HTN1P15515 57 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 COTL1Q14019 142 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 G3V4G9 280 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 IGHV3-30P01768 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 EMP1P54849 157 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 LRRK2Q5S007 2527 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 GAGE13Q4V321 117 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.11□□□□□ -1.27
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