RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 ORM1P02763 201 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT-ATP8P03928 68 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.86□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 H7C1H1 209 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 LGALS9O00182 355 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 OVOL1O14753 267 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCGB2A1O75556 95 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFE4Q86UQ8 179 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF183Q96D59 192 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM262E9PQX1 116 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 F8VRH5 84 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 GAS8-AS1O95177 125 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 PSMB2P49721 201 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 XGP55808 180 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 TEN1Q86WV5 123 aa8.84□□□□□ -0.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 GAGE5Q13069 117 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 GAGE6Q13070 117 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.83□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.82□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.82□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 METTL26Q96S19 204 aa8.82□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 LINC01549A6NIU2 74 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 K7EMT4 169 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF688P0C7X2 276 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF575Q86XF7 245 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 GLMPQ8WWB7 406 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 PEMTQ9UBM1 199 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 U3KQE9 123 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 BUB3O43684 328 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 Q8TAT8 98 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.81□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBE2D1P51668 147 aa8.8□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBE2D3P61077 147 aa8.8□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBE2D2P62837 147 aa8.8□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 A8MWV9 139 aa8.8□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -19e-7■■□□□ 12.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 CARD19Q96LW7 228 aa8.8□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 NRACQ8N912 160 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 SORL1Q92673 2214 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.79□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF815PA8K554 130 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGLV1-51P01701 117 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.78□□□□□ -1
TIMMDC1-208ENST00000494664 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTH2Q96A98 100 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 RBAKDNA6NC62 111 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 TOMM6Q96B49 74 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.77□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASIPP42127 132 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 M0QXV9 152 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 TCL1BO95988 128 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD7P09564 240 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 B5MCH6 92 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 H3BVH4 76 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 J3KRW8 73 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-208ENST00000494664 WIPF1O43516 503 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.9 ms