RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 NUPR1O60356 82 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 DEFB1P60022 68 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 DEFB125Q8N687 156 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 NDUFA1O15239 70 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 H0YGX0 51 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 H3BMG7 143 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 ESM1Q9NQ30 184 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 HIGD1BQ9P298 99 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 BAALCQ8WXS3 180 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 PIEZO1Q92508 2521 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 C11orf86A6NJI1 115 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 HAMPP81172 84 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 E9PLD3 99 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZSV7 163 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GXF2 115 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-213ENST00000489895 DSCAMO60469 2012 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 MLST8Q9BVC4 326 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 H3BQ85 93 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 TIRAPP58753 221 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 INAFM1C9JVW0 142 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 IGLV2-8P01709 118 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 LYRM9A8MSI8 78 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 DEFB4AO15263 64 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 CITED1Q99966 193 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 NPSP0C0P6 89 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 PTPN13Q12923 2485 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 ATRXP46100 2492 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 IGLC6P0CF74 106 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 Q8N6K4 173 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 IGLL5B9A064 214 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 KLK12Q9UKR0 248 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 A4D1N5 150 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 ODF1Q14990 250 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 SPAG11BQ08648 103 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 ACYP1P07311 99 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-213ENST00000489895 PSMB8P28062 276 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 NACAE9PAV3 2078 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 CCL25O15444 150 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZTI0 123 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 ZNF702PQ9H963 129 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 H7C423 109 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 LY6G6DO95868 133 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 MBD6Q96DN6 1003 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 TNCP24821 2201 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 C20orf173Q96LM9 149 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 TDRG1Q3Y452 100 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 C14orf177Q52M58 125 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 LRP4O75096 1905 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 NAV2Q8IVL1 2488 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 MIFP14174 115 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 HILS1P60008 231 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 SPATA25Q9BR10 227 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 PTPRSQ13332 1948 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-213ENST00000489895 CRYBA4P53673 196 aa12.77□□□□□ -0.36
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