RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 M0R2P5 195 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 M0R381 172 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 GYPEP15421 78 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 SSTP61278 116 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 ZFP82Q8N141 532 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 PTH2Q96A98 100 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 NTF3P20783 257 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 SRIP30626 198 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 XGP55808 180 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 SLAQ13239 276 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 RIGQ13278 110 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 BORCS7Q96B45 105 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WTM6 91 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 COLCA2A8K830 154 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-1P60331 282 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 HBBP68871 147 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 TWIST1Q15672 202 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 ZNF876PQ49A33 203 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 SYT8Q8NBV8 401 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 RASL10AQ92737 203 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 JPT2Q9H910 190 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GW15 77 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 EREGO14944 169 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 CAMPP49913 170 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 EPM2AB3EWF7 344 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 HAMPP81172 84 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 NFE4Q86UQ8 179 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 GATD1Q8NB37 220 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 RS1O15537 224 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 TRGC1P0CF51 173 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 EVI2AP22794 236 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 RASL11AQ6T310 242 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 AP1S3Q96PC3 154 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 FAT1Q14517 4588 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 S100A8P05109 93 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 CRYGDP07320 174 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WWL8 130 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 A8MWV9 139 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 RAB5AP20339 215 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 RAB4BP61018 213 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 COX19Q49B96 90 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 Q5VSD8 79 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DQA1P01909 254 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 AMN1Q8IY45 258 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 RNF185Q96GF1 192 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 HERC1Q15751 4861 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 MGPP08493 103 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 GCSHP23434 173 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 RHODO00212 210 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 MT-ND6P03923 174 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 SMIM17P0DL12 118 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 RAB4AP20338 218 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 Q9HAA7 133 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 K7EP13 123 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-30P01768 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-33P01772 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 APCSP02743 223 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZSN1 163 aa8.45□□□□□ -1.06
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