RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q6ZR54	194 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		M0R381	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	PSCA	O43653	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		H7C1H1	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RTL8C	O15255	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		P01737	135 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CRYGD	P07320	174 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CXCL1	P09341	107 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	BCL2	P10415	239 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	PKIA	P61925	76 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCL20	P78556	96 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A087WX48	190 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		F2Z2F3	143 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CACNG7	P62955	275 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GAGE5	Q13069	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ELOB	Q15370	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF56	Q15929	161 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	LELP1	Q5T871	98 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RMI2	Q96E14	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	PARL	Q9H300	379 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GUV1	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CRIP1	P50238	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CEBPG	P53567	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00315	P59091	139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB4B	P61018	213 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SST	P61278	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	VCY	O14598	125 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	SNAI2	O43623	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	CRP	P02741	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	MGP	P08493	103 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	CAMP	P49913	170 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB14	P61106	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	LAGE3	Q14657	143 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q9HAA7	133 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550		A8MWL6	223 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SH3BGR-208	ENST00000452550	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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