RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CXCL1P09341 107 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SRIP30626 198 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 CSN1S1P47710 185 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF415Q09FC8 603 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SLAQ13239 276 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 WFDC2Q14508 124 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 CENPWQ5EE01 88 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP82Q8N141 532 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM12Q96EX1 92 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 FMC1Q96HJ9 113 aa4.36□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.35□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.35□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.35□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.35□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.34□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.34□□□□□ -1.71
HOXD8-202ENST00000429017 Q6AWC8 147 aa4.34□□□□□ -1.71
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 K7EN84 100 aa4.33□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BOP23527 126 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BBP33778 126 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 AKR1D1P51857 326 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BDP58876 126 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BCP62807 126 aa4.33□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 COX19Q49B96 90 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.33□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZSA8 131 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 SPXQ9BT56 116 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 Q9HAA7 133 aa4.33□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 PSCAO43653 123 aa4.32□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.32□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA6P56556 154 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 TIRAPP58753 221 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 GNG5P63218 68 aa4.32□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00479Q96M42 142 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXD8-202ENST00000429017 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.32□□□□□ -1.72
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HOXD8-202ENST00000429017 A8MWL6 223 aa4.32□□□□□ -1.72
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