RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362076.8

C1orf43-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf43, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-202ENST00000362076 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.53□□□□□ -0.56
C1orf43-202ENST00000362076 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.53□□□□□ -0.56
C1orf43-202ENST00000362076 VAMP8Q9BV40 100 aa11.53□□□□□ -0.56
C1orf43-202ENST00000362076 VWFP04275 2813 aa11.52□□□□□ -0.56
C1orf43-202ENST00000362076 IGHV3-53P01767 116 aa11.52□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.52□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 NACAE9PAV3 2078 aa11.52□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 LINC01545Q5VT33 79 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF664Q8N3J9 261 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.51□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 TOMM6Q96B49 74 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.5□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 I3L3M4 83 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 RHOHQ15669 191 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZTI0 123 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 H0Y8G0 127 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 PRSS1P07477 247 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 RIPPLY3P57055 190 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 C18orf15Q96N68 181 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf43-202ENST00000362076 MAST4O15021 2626 aa11.46□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 PRO1933Q9H354 126 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 A8MZ25 164 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZN92 141 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZSN1 163 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 ERASQ7Z444 233 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 X6R8D5 127 aa11.45□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 SPATA45Q537H7 98 aa11.44□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.44□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF479Q96JC4 524 aa11.44□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 GAGE12BA1L429 117 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 GAGE7O76087 117 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 GAGE12FP0CL80 117 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 GAGE12GP0CL81 117 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 GAGE12IP0CL82 117 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 ATOH7Q8N100 152 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 STAB1Q9NY15 2570 aa11.43□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TSHBP01222 138 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 DDTP30046 118 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TMEM141Q96I45 108 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 ZMAT4Q9H898 229 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.42□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 LYRM9A8MSI8 78 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 K7EQD1 137 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 P0DMU3 169 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 FAM231AP0DMU4 169 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 FAM231CP0DMU5 169 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 MIFP14174 115 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 DEFB135Q30KP9 77 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 OR11H2Q8NH07 326 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TIMM17AQ99595 171 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP10-11P60412 298 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 ODF1Q14990 250 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 RNF183Q96D59 192 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.41□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 A0A087WX48 190 aa11.4□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 EMP1P54849 157 aa11.4□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.4□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.4□□□□□ -0.58
C1orf43-202ENST00000362076 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.39□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 IGIPA6NJ69 53 aa11.39□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.39□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 COL6A5A8TX70 2615 aa11.38□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 NPSP0C0P6 89 aa11.38□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 COTL1Q14019 142 aa11.38□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.38□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.38□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 DPM2O94777 84 aa11.37□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 PLNP26678 52 aa11.37□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.37□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.37□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.37□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 LINC00587B1AMM8 73 aa11.37□□□□□ -0.59
C1orf43-202ENST00000362076 IGKCP01834 107 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.1 ms