RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531243.2

PABPC4-225, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 4, human

TSL 4

Gene PABPC4, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC4-225	ENST00000531243	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	GTSF1	Q8WW33	167 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	CNFN	Q9BYD5	112 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	HIGD1C	A8MV81	97 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	NUDT3	O95989	172 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	ADCYAP1	P18509	176 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	NTF3	P20783	257 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	TWIST1	Q15672	202 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	JPT2	Q9H910	190 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	RHOH	Q15669	191 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	NDUFA5	Q16718	116 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243		A0A087WWL8	130 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	RNF212	Q495C1	297 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243		A0A1B0GUT8	65 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	CRYGD	P07320	174 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PABPC4-225	ENST00000531243	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	RAB4B	P61018	213 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	RIG	Q13278	110 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	ZNF56	Q15929	161 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243		K7EQD1	137 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243		P0DMU3	169 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	FAM231A	P0DMU4	169 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	FAM231C	P0DMU5	169 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	NUP35	Q8NFH5	326 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243		F5H697	171 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	GYPE	P15421	78 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	SRI	P30626	198 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243		A0A1B0GW15	77 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	MGP	P08493	103 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	EVI2A	P22794	236 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243		A0A096LPF7	62 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243		H7C1H1	209 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	S100A8	P05109	93 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	CCL18	P55774	89 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	RHEB	Q15382	184 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		14.84	□□□□□ -0.03
PABPC4-225	ENST00000531243	APOC3	P02656	99 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	SVBP	Q8N300	66 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	IMMP2L	Q96T52	175 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	SNAPIN	O95295	136 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	LY6G6C	O95867	125 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243		Q6ZSN1	163 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243		A0A087WWC5	75 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		14.79	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	S100P	P25815	95 aa		14.79	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		14.79	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	FRZB	Q92765	325 aa		14.79	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		14.79	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	GAGE12J	A6NER3	117 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	LINC00315	P59091	139 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	HBB	P68871	147 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	GAGE1	Q13065	139 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	GAGE4	Q13068	117 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	GAGE5	Q13069	117 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	GAGE13	Q4V321	117 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	BTF3L4	Q96K17	158 aa		14.78	□□□□□ -0.04
PABPC4-225	ENST00000531243	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	LCE6A	A0A183	80 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	CAMP	P49913	170 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		14.77	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	RASL11A	Q6T310	242 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PABPC4-225	ENST00000531243	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		14.76	□□□□□ -0.05

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