RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APCSP02743 223 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAD1P61803 113 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMN1Q8IY45 258 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.07□□□□□ -1.44
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT-ND6P03923 174 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYGDP07320 174 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB4AP20338 218 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF56Q15929 161 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GATD1Q8NB37 220 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF479Q96JC4 524 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CELA1Q9UNI1 258 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHODO00212 210 aa6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CKS2P33552 79 aa6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.05□□□□□ -1.44
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNHD1Q96M86 4753 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMKR1H3BMG3 65 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRGC2P03986 189 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HTN3P15516 51 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00315P59091 139 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLAQ13239 276 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf74Q32Q52 190 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF185Q96GF1 192 aa6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 D6R8Y8 96 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F5H768 121 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CIDEAO60543 219 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCR2O95944 276 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5G1P05496 136 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FHL2Q14192 279 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZSN1 163 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRAP2Q96G30 205 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C18orf15Q96N68 181 aa6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 U3KQK5 164 aa6.03□□□□□ -1.44
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOTCH1P46531 2555 aa6.02□□□□□ -1.45
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAS8-AS1O95177 125 aa6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXA5P20719 270 aa6.01□□□□□ -1.45
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM231AP0DMU4 169 aa6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM231CP0DMU5 169 aa6□□□□□ -1.45
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6□□□□□ -1.45
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST20Q9HBF5 79 aa6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NIT2Q9NQR4 276 aa6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRO0255Q9UI72 69 aa6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE12JA6NER3 117 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPYP01303 97 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYBA4P53673 196 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE1Q13065 139 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE4Q13068 117 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE5Q13069 117 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHOHQ15669 191 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE13Q4V321 117 aa5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAGE3Q86Y29 109 aa5.99□□□□□ -1.45
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