RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522018.1

TERF1-208, Transcript of telomeric repeat binding factor 1, human

TSL 3

Gene TERF1, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TERF1-208	ENST00000522018	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.36	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018		Q6ZUT4	128 aa		0.36	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	C20orf197	Q8N268	126 aa		0.36	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	PLXNA2	O75051	1894 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	CACNA1E	Q15878	2313 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	COX4I1	P13073	169 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		0.35	□□□□□ -2.35
TERF1-208	ENST00000522018	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	COX7B2	Q8TF08	81 aa		0.34	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018		F2Z2F3	143 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	COPZ1	P61923	177 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	UBE2G1	P62253	170 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018		Q96NJ1	140 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	SDF2	Q99470	211 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	PROK2	Q9HC23	129 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	MED13L	Q71F56	2210 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	CEP152	O94986	1710 aa		0.33	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	JMJD1C	Q15652	2540 aa		0.32	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	SOGA1	O94964	1423 aa		0.32	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		0.32	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		0.32	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	PRR15L	Q9BU68	103 aa		0.32	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.32	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	IL5	P05113	134 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	RPRM	Q9NS64	109 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018		V9GYV3	84 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	ADGRB1	O14514	1584 aa		0.31	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018		A6NIN4	97 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	C10orf82	Q8WW14	230 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	PFDN5	Q99471	154 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	UBE2D1	P51668	147 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	SPTSSA	Q969W0	71 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	DPH3	Q96FX2	82 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TERF1-208	ENST00000522018	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	NDUFB6	O95139	128 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	F5	P12259	2224 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	SNCG	O76070	127 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	IFNA17	P01571	189 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	CBLN1	P23435	193 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	EDDM3B	P56851	147 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	MYH6	P13533	1939 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	NDUFA2	O43678	99 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	ACYP2	P14621	99 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	ARPC4	P59998	168 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	S100A12	P80511	92 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	CCDC58	Q4VC31	144 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018		Q6ZRX8	168 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	KDM6B	O15054	1643 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	APOD	P05090	189 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	NMB	P08949	121 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	INSL4	Q14641	139 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.24	□□□□□ -2.37
TERF1-208	ENST00000522018	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.24	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.3 ms