RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 C12orf77C9JDV5 145 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 COX7A2P2O60397 106 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.365e-12■■□□□ 13.8
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF136P52737 540 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 NNATQ16517 81 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 SPINK14Q6IE38 97 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 DIRC1Q969H9 104 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H4GQ99525 98 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 Q9H3A6 140 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 K7ERJ3 54 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1-5P01602 117 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 MDP1Q86V88 176 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 DOCK7Q96N67 2140 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 MAST4O15021 2626 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GWA3 101 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 PINLYPA6NC86 204 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00313P59037 77 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 INSL4Q14641 139 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF627Q7L945 461 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 NUP37Q8NFH4 326 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 XCL2Q9UBD3 114 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GW54 56 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL3P10147 92 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP10-2P60368 255 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF714Q96N38 554 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 NOTCH2Q04721 2471 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 POLQO75417 2590 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 LRBAP50851 2863 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C17orf51A8MQB3 221 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C19orf84I3L1E1 186 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNHIT1O43257 154 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A16P16260 332 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SS18Q15532 418 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 MORN5Q5VZ52 161 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 PROK2Q9HC23 129 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0B4J2C4 111 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C9JCJ5 164 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 PPYP01298 95 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 PLA2G2AP14555 144 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 LMO4P61968 165 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 KLKP1Q107X0 134 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 Q1T7F1 81 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 AKAP6Q13023 2319 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A087X002 238 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PQD3 144 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 E7EQL1 145 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 GNB1P62873 340 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 TWIST1Q15672 202 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ATXN8Q156A1 80 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01554Q52M75 96 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZRM9 215 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 CD177Q8N6Q3 437 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF747Q9BV97 191 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.49□□□□□ -1.37
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