RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.3□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.3□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-0.3□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 A0A096LPI6 279 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 A0A0J9YY99 117 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 RER1O15258 196 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 COX6B1P14854 86 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SPA17Q15506 151 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 LYG2Q86SG7 212 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 C3P01024 1663 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-0.31□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 TIAM1Q13009 1591 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 NFAT5O94916 1531 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 C4AP0C0L4 1744 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 C4BP0C0L5 1744 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 DOCK1Q14185 1865 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 IQGAP1P46940 1657 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SERPINA1P01009 418 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 AKIRIN2Q53H80 203 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 CASC2Q6XLA1 102 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 FGD6Q6ZV73 1430 aa-0.32□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 H0YAA0 97 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 GPR31O00270 319 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SPINK1P00995 79 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 TRGC2P03986 189 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 CAV3P56539 151 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SPINK13Q1W4C9 94 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 Q5XG85 94 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 C10orf111Q8N326 155 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 MALSU1Q96EH3 234 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 ARMC1Q9NVT9 282 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 NUP210LQ5VU65 1888 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.33□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 DLEC1Q9Y238 1755 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 CEP152O94986 1710 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 CD3DP04234 171 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 GNG5P63218 68 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 MT1MQ8N339 61 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 OR2J1Q9GZK6 312 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.34□□□□□ -2.46
CMC1-211ENST00000495428 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 BTAF1O14981 1849 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 NDUFC2O95298 119 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 IFNA4P05014 189 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 Q5BKY6 102 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 CST11Q9H112 138 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 LPAR5Q9H1C0 372 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PRNDQ9UKY0 176 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 KIF1AQ12756 1690 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 UBR2Q8IWV8 1755 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 DEPDC5O75140 1603 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.35□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PLXNC1O60486 1568 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ABCA8O94911 1581 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SOGA1O94964 1423 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ABCC2Q92887 1545 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PIAS1O75925 651 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 IFT20Q8IY31 132 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 DPH3Q96FX2 82 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.6 ms