RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.98□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 BIN3Q9NQY0 253 aa5.98□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 NACAE9PAV3 2078 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 A0A087WWL8 130 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 CIDEAO60543 219 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 CRYGDP07320 174 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 OR5AL1P0C617 328 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 CCL18P55774 89 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 SSTP61278 116 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 PEA15Q15121 130 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZSN1 163 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.96□□□□□ -1.45
PKP4-216ENST00000495123 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 M0R2N4 97 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SRIP30626 198 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RHOHQ15669 191 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 LINC01551Q86U37 167 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TPPP3Q9BW30 176 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 Q9UF83 564 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 KMT2AQ03164 3969 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 XKRY2A2RUG3 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RHODO00212 210 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RAB14P61106 215 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 CLLU1Q5K131 121 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 UPK3BQ9BT76 320 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GAGE12JA6NER3 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 ERVFC1-1P60608 527 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GAGE1Q13065 139 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GAGE4Q13068 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GAGE5Q13069 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GAGE13Q4V321 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZR54 194 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GTSF1Q8WW33 167 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 Q9H8V8 135 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PPQ1 181 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 F2Z2F3 143 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 LINC00694P0DN24 101 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 CTRLP40313 264 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 CACNG7P62955 275 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 ISOC2Q96AB3 205 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 NAT8Q9UHE5 227 aa5.93□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 NTF3P20783 257 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 LINC00315P59091 139 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 ADIRFQ15847 76 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 ZNF56Q15929 161 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 CT83Q5H943 113 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 AP1S3Q96PC3 154 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 CNFNQ9BYD5 112 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 OSTCQ9NRP0 149 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 V9GYV3 84 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 A8MWL6 223 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 MGPP08493 103 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SMIM17P0DL12 118 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 EVI2AP22794 236 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RAB4BP61018 213 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TWIST1Q15672 202 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 WDR73Q6P4I2 378 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 F5H697 171 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 RTL8CO15255 209 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 SIVA1O15304 175 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TRGC1P0CF51 173 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TIRAPP58753 221 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 TSKUQ8WUA8 353 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-216ENST00000495123 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms