RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	EMX2	Q04743	252 aa		0.42	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	C20orf197	Q8N268	126 aa		0.42	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		0.42	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		0.42	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419		F2Z2F3	143 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	PITX3	O75364	302 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	SPCS2	Q15005	226 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		0.41	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
FAM208B-208	ENST00000482419	NPFF	O15130	113 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	NCR2	O95944	276 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	CCL3L1	P16619	93 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419		Q6ZUT4	128 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	PARP14	Q460N5	1801 aa		0.4	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	RBAKDN	A6NC62	111 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	IL5	P05113	134 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	COPZ1	P61923	177 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	COX7B2	Q8TF08	81 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.39	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	F5	P12259	2224 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419		A0A087WTM6	91 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419		A6NIN4	97 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	UBE2G1	P62253	170 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	C10orf82	Q8WW14	230 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	PRR15L	Q9BU68	103 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SPEF2	Q9C093	1822 aa		0.38	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	CACNA1E	Q15878	2313 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	PFDN5	Q99471	154 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	RPRM	Q9NS64	109 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419		V9GYV3	84 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SOGA1	O94964	1423 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.37	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SNCG	O76070	127 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	PROK2	Q9HC23	129 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	ADGRB1	O14514	1584 aa		0.36	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	LAMB1	P07942	1786 aa		0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	ACYP2	P14621	99 aa		0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	SPTSSA	Q969W0	71 aa		0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419		Q96NJ1	140 aa		0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	JMJD1C	Q15652	2540 aa		0.35	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		0.34	□□□□□ -2.35
FAM208B-208	ENST00000482419	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		0.34	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		0.34	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	SDF2	Q99470	211 aa		0.34	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	KDM6B	O15054	1643 aa		0.34	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		0.33	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		0.33	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM107B	Q9H098	131 aa		0.33	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	NDUFB6	O95139	128 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	APOD	P05090	189 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	UBE2D1	P51668	147 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	EDDM3B	P56851	147 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		0.32	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	MAST4	O15021	2626 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	IFNA17	P01571	189 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	NMB	P08949	121 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	CBLN1	P23435	193 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	ARPC4	P59998	168 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	CCDC58	Q4VC31	144 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.3	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419		Q6ZRX8	168 aa		0.3	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	DPH3	Q96FX2	82 aa		0.3	□□□□□ -2.36

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