RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.97□□□□□ -1.29
HDLBP-211ENST00000425989 COL6A5A8TX70 2615 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 D6R8Y8 96 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 G0S2P27469 103 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 NIT1Q86X76 327 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01549A6NIU2 74 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TCAPO15273 167 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 RS1O15537 224 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 SPRY2O43597 315 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 CRYGDP07320 174 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 IL17DQ8TAD2 202 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 RNF183Q96D59 192 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF6BO95407 300 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 MIFP14174 115 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 AZU1P20160 251 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00315P59091 139 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP10-11P60412 298 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 C18orf15Q96N68 181 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 STAB1Q9NY15 2570 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01546A6NGU7 62 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 LYRM9A8MSI8 78 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 F5H697 171 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 HSBP1O75506 76 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 FA2HQ7L5A8 372 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 VCYO14598 125 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 SERF1AO75920 110 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N8P6 123 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 ST20Q9HBF5 79 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 NIT2Q9NQR4 276 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 G3V4G9 280 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-53P01767 116 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 MGPP08493 103 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 NRACQ8N912 160 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 OR11H2Q8NH07 326 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 X6R8D5 127 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 VWFP04275 2813 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WWL8 130 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 M0QY20 66 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 NPYP01303 97 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 AKR1D1P51857 326 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF56Q15929 161 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 JPT2Q9H910 190 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-211ENST00000425989 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 PRM2P04554 102 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 IQCJQ1A5X6 159 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 KIR2DL4Q99706 377 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 NACAE9PAV3 2078 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 SMKR1H3BMG3 65 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 NUPR1O60356 82 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 FABP4P15090 132 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 FCER1GP30273 86 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 AMTP48728 403 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 LAGE3Q14657 143 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB135Q30KP9 77 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZTI0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms