RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RNF185Q96GF1 192 aa12.15□□□□□ -0.46
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HOXD12-201ENST00000404162 CNBPP62633 177 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf17Q8NAS9 161 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SPACA4Q8TDM5 124 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPV4 95 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC160A6NGH7 325 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 H2AFB2P0C5Z0 115 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 WDR73Q6P4I2 378 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SFRP2Q96HF1 295 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.12□□□□□ -0.47
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HOXD12-201ENST00000404162 ARMS2P0C7Q2 107 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 RAB2AP61019 212 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PRR34Q9NV39 138 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf33Q8WU49 177 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM3Q9BZL3 60 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 GRIFINA4D1Z8 144 aa12.1□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 B4DEV8 164 aa12.1□□□□□ -0.47
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HOXD12-201ENST00000404162 ARL14EPLP0DKL9 152 aa12.1□□□□□ -0.47
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HOXD12-201ENST00000404162 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa12.1□□□□□ -0.47
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HOXD12-201ENST00000404162 hDV102S1A0JD36 115 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 DNLZQ5SXM8 178 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 OR10G8Q8NGN5 311 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 HSPB11Q9Y547 144 aa12.09□□□□□ -0.47
HOXD12-201ENST00000404162 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 GTSF1Q8WW33 167 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV34A0A0B4J273 112 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 KRBOX1C9JBD0 128 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 M0R036 132 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 M0R381 172 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 RBX1P62877 108 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 SUN5Q8TC36 379 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 STAG3L2P0CL84 134 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 STAG3L3P0CL85 134 aa12.06□□□□□ -0.48
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HOXD12-201ENST00000404162 WFDC1Q9HC57 220 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa12.06□□□□□ -0.48
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HOXD12-201ENST00000404162 PKIAP61925 76 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 GAGE6Q13070 117 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 MUC2Q02817 5179 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa12.04□□□□□ -0.48
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HOXD12-201ENST00000404162 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXD12-201ENST00000404162 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
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HOXD12-201ENST00000404162 REG3AQ06141 175 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PRR27Q6MZM9 219 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 LYPD6BQ8NI32 183 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 RAB4BP61018 213 aa12.01□□□□□ -0.49
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HOXD12-201ENST00000404162 ZFP82Q8N141 532 aa12.01□□□□□ -0.49
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HOXD12-201ENST00000404162 RAB24Q969Q5 203 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa12□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 SH2D1AO60880 128 aa12□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 RAB5CP51148 216 aa12□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 CYCSP99999 105 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF56Q15929 161 aa12□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
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HOXD12-201ENST00000404162 STPG4Q8N801 248 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 DERL1Q9BUN8 251 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 MPC2O95563 127 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 H2BFSP57053 126 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXD12-201ENST00000404162 P01737 135 aa11.97□□□□□ -0.49
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