RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM160Q9NX00 188 aa12.31□□□□□ -0.44
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
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SHQ1-201ENST00000325599 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
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SHQ1-201ENST00000325599 BAALCQ8WXS3 180 aa12.17□□□□□ -0.46
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa12.17□□□□□ -0.46
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SHQ1-201ENST00000325599 F5H697 171 aa12.16□□□□□ -0.46
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