RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 PROP1O75360 226 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF134P52741 427 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 DAND5Q8N907 189 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 APOC4P55056 127 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00310P59036 64 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 SDK2Q58EX2 2172 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0J9YXY3 114 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 WDR86Q86TI4 376 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 PRORYQ9H606 182 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 MDFICQ9P1T7 246 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRO-201ENST00000281171 FOXE3Q13461 319 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZQT7 251 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 DEFB131AP59861 70 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 Q6JHZ5 121 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 RNF223E7ERA6 249 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 MLST8Q9BVC4 326 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 RMI2Q96E14 147 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 PI4KAP42356 2102 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 SNURFQ9Y675 71 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1671Q9BY89 1806 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 NFE4Q86UQ8 179 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 CDIP1Q9H305 208 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 GNRH2O43555 120 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2BP63146 152 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 LST1O00453 97 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV3-30P01768 117 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 PRSS33Q8NF86 280 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 A6NED7 52 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 TEX22C9J3V5 150 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 Q96MF0 132 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 U3KQK5 164 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM89A2RUT3 159 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2AP49459 152 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 LHBP01229 141 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 MED14OSP0DP75 135 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 NPBQ8NG41 125 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 H7C423 109 aa11.02□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
PTPRO-201ENST00000281171 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF524Q96C55 264 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 TIRAPP58753 221 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 LY6HO94772 140 aa11□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 SHANK1Q9Y566 2161 aa11□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 CEP250Q9BV73 2442 aa11□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 BPY2O14599 106 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 PSCAO43653 123 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 VPREB1P12018 145 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 SPRY2O43597 315 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 MIFP14174 115 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRO-201ENST00000281171 IGLV2-14P01704 120 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms