RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX261Q6UWH6 196 aa13.39□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R2P5 195 aa13.38□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL2P10415 239 aa13.38□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKR1C3P42330 323 aa13.38□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.38□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.37□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.37□□□□□ -0.27
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV3-53P01767 116 aa13.37□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TYMSP04818 313 aa13.37□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLST8Q9BVC4 326 aa13.37□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.37□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAX4O43316 350 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNA1P01562 189 aa13.36□□□□□ -0.27
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRIP1P50238 77 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RASL10AQ92737 203 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRO0255Q9UI72 69 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VAX2Q9UIW0 290 aa13.36□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP10-2P60368 255 aa13.35□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.35□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A096LPF7 62 aa13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDE6DO43924 150 aa13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DERL1Q9BUN8 251 aa13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.34□□□□□ -0.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.33□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.33□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.32□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ORM1P02763 201 aa13.32□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.32□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CIDEAO60543 219 aa13.31□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASIPP42127 132 aa13.31□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF876PQ49A33 203 aa13.31□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.31□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B4DEV8 164 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9JCJ5 164 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIVA1O15304 175 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV2-8P01709 118 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRYBA4P53673 196 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00315P59091 139 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FHL2Q14192 279 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAGE2Q86Y30 109 aa13.3□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.29□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH2D1AO60880 128 aa13.29□□□□□ -0.28
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.29□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM210AQ96ND0 272 aa13.29□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.29□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HERC1Q15751 4861 aa13.29□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM250H0YL14 139 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFTA3P0C7M3 94 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNLZQ5SXM8 178 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTH2Q96A98 100 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF479Q96JC4 524 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf85Q96MD7 179 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED9Q9NWA0 146 aa13.28□□□□□ -0.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB19A4D1S5 217 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRIP30626 198 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01559Q495D7 138 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CENPWQ5EE01 88 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYT8Q8NBV8 401 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM12Q96EX1 92 aa13.27□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EREGO14944 169 aa13.26□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAT1Q14517 4588 aa13.26□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.26□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.26□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R036 132 aa13.25□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NXPH4O95158 308 aa13.25□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOR2AQ5JU69 321 aa13.25□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.25□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL36BQ9NZH7 164 aa13.25□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GYPEP15421 78 aa13.24□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNG4P50150 75 aa13.24□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.24□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A8MWV9 139 aa13.23□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RS1O15537 224 aa13.23□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERVFC1-1P60608 527 aa13.23□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.23□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFE4Q86UQ8 179 aa13.23□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARLQ9H300 379 aa13.23□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPM2AB3EWF7 344 aa13.22□□□□□ -0.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BVH4 76 aa13.22□□□□□ -0.29
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