RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 ISOC2Q96AB3 205 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 NUDT11Q96G61 164 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RETNQ9HD89 108 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 IL36BQ9NZH7 164 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 A0A0J9YWU9 116 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 FAM231BA6NCW3 169 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TYMSP04818 313 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TRGC1P0CF51 173 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 AZU1P20160 251 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 SLAQ13239 276 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 KIR3DS1Q14943 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 ZNF876PQ49A33 203 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 X6R8D5 127 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 A8MWV9 139 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 C9JQL5 133 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 H3BVH4 76 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GNRH2O43555 120 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 DEFB130BP0DP73 79 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 DEFB130AP0DP74 79 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RIGQ13278 110 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TSKUQ8WUA8 353 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 A0A1B0GW15 77 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 K7EN84 100 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 M0R381 172 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RHODO00212 210 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 IGLV2-8P01709 118 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 ATP5G1P05496 136 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 OR5AL1P0C617 328 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 CRIP1P50238 77 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TWIST1Q15672 202 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 DNLZQ5SXM8 178 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 WDR73Q6P4I2 378 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 Q8NAQ8 132 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 AP1S3Q96PC3 154 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GAGE12BA1L429 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 DEFB4AO15263 64 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GAGE7O76087 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GAGE12FP0CL80 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GAGE12GP0CL81 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 GAGE12IP0CL82 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 PTH2Q96A98 100 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 IMMP2LQ96T52 175 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 DKK2Q9UBU2 259 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 A0A087WWC5 75 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 A0A1B0GUT8 65 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 HIGD1CA8MV81 97 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 SPINK4O60575 86 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 HTN3P15516 51 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 S100A1P23297 94 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RNF212Q495C1 297 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 MDFICQ9P1T7 246 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 NUPR2A6NF83 97 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 F5H697 171 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 H7C1H1 209 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 SSTP61278 116 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 RASL10AQ92737 203 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 C9orf85Q96MD7 179 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-218ENST00000550159 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-218ENST00000550159 F5H768 121 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.5 ms