RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	VAMP3	Q15836	100 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	RNF223	E7ERA6	249 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404		K7EMI3	77 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	FSHB	P01225	129 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59	1e-8	■■■■■ 32.5
FADS3-208	ENST00000529404		A0A087WX48	190 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	TGFA	P01135	160 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	SCGB1A1	P11684	91 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	C7orf71	A4D174	169 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	HIGD1B	Q9P298	99 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FADS3-208	ENST00000529404	LINC00315	P59091	139 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		A6NDN8	102 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	PPP1R17	O96001	155 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	COX6B1	P14854	86 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	FLNC	Q14315	2725 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		H3BRM9	83 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	MGP	P08493	103 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		Q6YL49	198 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM160	Q9NX00	188 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		K7EQG2	157 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	LGALS9	O00182	355 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	PRB1	P04280	392 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		A0A0J9YX75	114 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	ELANE	P08246	267 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		A0A087WW49	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		H7C1H1	209 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	PLN	P26678	52 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	MUC4	Q99102	2169 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	C9orf118	A6NHY6	69 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404		F8VRH5	84 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	CD7	P09564	240 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.27	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.27	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	JPT2	Q9H910	190 aa		11.27	□□□□□ -0.6
FADS3-208	ENST00000529404	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	FBN2	P35556	2912 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404		G3V4G9	280 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	FXYD2	P54710	66 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF843	Q8N446	348 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FADS3-208	ENST00000529404		A0A087WWL8	130 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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