RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPG11Q96JI7 2443 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF815PA8K554 130 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR11H12B2RN74 326 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARL3P36405 182 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXI1Q12951 378 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR11H1Q8NG94 326 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR11H2Q8NH07 326 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAXQ9Y2V3 346 aa5.18□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLNP26678 52 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 XGP55808 180 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CKS1BP61024 79 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOMM6Q96B49 74 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCGB2A1O75556 95 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 COX6B1P14854 86 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 C16orf92Q96LL3 132 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 C11orf86A6NJI1 115 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCL21O00585 134 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCGB2A2Q13296 93 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF580Q9UK33 172 aa5.17□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCL1BO95988 128 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CITED1Q99966 193 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CENPEQ02224 2701 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A087WWL8 130 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD7P09564 240 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBAKDNA6NC62 111 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.16□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV3-11P01762 117 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 ELANEP08246 267 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAA4P35542 130 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRYBA4P53673 196 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 EBI3Q14213 229 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAX2Q96IS3 184 aa5.15□□□□□ -1.58
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFC1BP0CG36 223 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFC1P0CG37 223 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2D1P51668 147 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAL2Q16559 108 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPINK8P0C7L1 97 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.15□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.592e-23■■■□□ 17.5
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBN2P35556 2912 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0J9YY99 117 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 H7C2G1 150 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 M0R1W7 72 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00315P59091 139 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 METTL26Q96S19 204 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 FLNCQ14315 2725 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 SIRPDQ9H106 197 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 CREBBPQ92793 2442 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.14□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1B0GV72 72 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2D3P61077 147 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2D2P62837 147 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 U3KQE9 123 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 J3QR89 54 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCGB1A1P11684 91 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZUT4 128 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRAP2Q96G30 205 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGIPA6NJ69 53 aa5.13□□□□□ -1.59
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.13□□□□□ -1.59
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