RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 FOXC2Q99958 501 aa12.75□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 JMJD1CQ15652 2540 aa12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 ODF1Q14990 250 aa12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.74□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 8.2
PFKL-211ENST00000498841 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 RNF223E7ERA6 249 aa12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 C8orf86Q6ZUL3 223 aa12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 FCER1GP30273 86 aa12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 PDE6HQ13956 83 aa12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 TMEM160Q9NX00 188 aa12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 TENM4Q6N022 2769 aa12.72□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 IGKCP01834 107 aa12.72□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.72□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 INSL3P51460 131 aa12.72□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.72□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 CEND1Q8N111 149 aa12.71□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 ZNF479Q96JC4 524 aa12.71□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.71□□□□□ -0.37
PFKL-211ENST00000498841 TMEM8BA6NDV4 472 aa12.71□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 IGLL5B9A064 214 aa12.71□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 IGKV3-20P01619 116 aa12.71□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 DEFB112Q30KQ8 113 aa12.71□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.71□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 HECTD1Q9ULT8 2610 aa12.7□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.7□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.7□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TMEM78Q5T7P6 136 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 RNF185Q96GF1 192 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 C20orf173Q96LM9 149 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 HIGD1BQ9P298 99 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 SFTA2Q6UW10 78 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.69□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 E9PLD3 99 aa12.68□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TNFRSF6BO95407 300 aa12.68□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.68□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.68□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 B4DSR2 109 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 DPM2O94777 84 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 COX6B1P14854 86 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 ZMAT4Q9H898 229 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 F8W1H4 67 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 J3QR89 54 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 TM2D2Q9BX73 214 aa12.67□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 C12orf74Q32Q52 190 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 PRR9Q5T870 116 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 HIST1H4GQ99525 98 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 H3BVH4 76 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 SCGB1A1P11684 91 aa12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 IGLC6P0CF74 106 aa12.65□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 ZNF575Q86XF7 245 aa12.65□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 NACAE9PAV3 2078 aa12.65□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.384e-8■■■□□ 15.9
PFKL-211ENST00000498841 GAGE13Q4V321 117 aa12.65□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 SMPXQ9UHP9 88 aa12.65□□□□□ -0.38
PFKL-211ENST00000498841 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 A6NDX4 124 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 M0R381 172 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 GATA3P23771 443 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 SPATA25Q9BR10 227 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 C20orf78Q9BR46 151 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.64□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa12.63□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 A0A1B0GWB2 263 aa12.63□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 DUX3Q96PT4 197 aa12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 IGHG2P01859 326 aa12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 SLC50A1Q9BRV3 221 aa12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 DEFB136Q30KP8 78 aa12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 ZNF843Q8N446 348 aa12.62□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 SPANXN1Q5VSR9 72 aa12.61□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.61□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 FAM223BA6NKX1 122 aa12.61□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.61□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 ATP5LO75964 103 aa12.6□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 GPHB5Q86YW7 130 aa12.6□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 RRN3P1Q2M238 152 aa12.6□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 MYOZ3Q8TDC0 251 aa12.6□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.6□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 ZNF688P0C7X2 276 aa12.6□□□□□ -0.39
PFKL-211ENST00000498841 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.8 ms