RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.4□□□□□ -0.58
ZBED1-202ENST00000381222 IGHG2P01859 326 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 JPT2Q9H910 190 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 DKK2Q9UBU2 259 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 CDKN1BP46527 198 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TACC2O95359 2948 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 FAM231BA6NCW3 169 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 FABP2P12104 132 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 FLNCQ14315 2725 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 PTPRBP23467 1997 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF815PA8K554 130 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 J3QLI3 93 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 PPP1R17O96001 155 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 Q6ZQT7 251 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 MRAP2Q96G30 205 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 F8P00451 2351 aa11.37□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 A6NDX4 124 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF124Q15973 351 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ITPR3Q14573 2671 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 LAMA5O15230 3695 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ELANEP08246 267 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 A0A096LPF7 62 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 IGLC3P0DOY3 106 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 EDN2P20800 178 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 LRBAP50851 2863 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 ATRQ13535 2644 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE12BA1L429 117 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 K7EMI3 77 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE7O76087 117 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE12FP0CL80 117 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE12GP0CL81 117 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE12IP0CL82 117 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 SMIM13P0DJ93 91 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 SPXQ9BT56 116 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 J3QR89 54 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 CRIP1P50238 77 aa11.35□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE12JA6NER3 117 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 CCL24O00175 119 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 CIDEAO60543 219 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE1Q13065 139 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE4Q13068 117 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE5Q13069 117 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 GAGE13Q4V321 117 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 VCYO14598 125 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 INSP01308 110 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 PRM2P04554 102 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 AGRNO00468 2067 aa11.34□□□□□ -0.59
ZBED1-202ENST00000381222 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.33□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF415Q09FC8 603 aa11.33□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.33□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 YPEL4Q96NS1 127 aa11.33□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 RNF114Q9Y508 228 aa11.33□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 MLST8Q9BVC4 326 aa11.32□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.32□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.32□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 C20orf173Q96LM9 149 aa11.32□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF747Q9BV97 191 aa11.32□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 C2orf70A6NJV1 201 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 MTURNQ8N3F0 131 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 MDFICQ9P1T7 246 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 SPCS1Q9Y6A9 102 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 ESM1Q9NQ30 184 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 PCP2Q8IVA1 136 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.31□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.3□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.3□□□□□ -0.6
ZBED1-202ENST00000381222 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms