RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0U1RRA0 63 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1B0GWB2 263 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 RBAKDNA6NC62 111 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 CIDEAO60543 219 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 IGLV2-11P01706 119 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 LINC01559Q495D7 138 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 XCL2Q9UBD3 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 SAP30O75446 220 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 FSTL3O95633 263 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 LINC01545Q5VT33 79 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 CDKN1BP46527 198 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 RIPPLY3P57055 190 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 IGF1P05019 195 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 PRORYQ9H606 182 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 GAGE12BA1L429 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 IGHG2P01859 326 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 CTRLP40313 264 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 EBI3Q14213 229 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 H3BUA1 57 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 NPC2P61916 151 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM262E9PQX1 116 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 K7ERJ3 54 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 SLURP1P55000 103 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF415Q09FC8 603 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 LINC01619G3V211 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 K7EMI3 77 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 Q8N6K4 173 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 SPXQ9BT56 116 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 COX6CP09669 75 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 PAX2Q02962 417 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 MTURNQ8N3F0 131 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 F8VRH5 84 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 J3QLI3 93 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 ELANEP08246 267 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRK-206ENST00000368215 MTORP42345 2549 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 A6NDX4 124 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 JPT2Q9H910 190 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 A0A087WW49 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 INSP01308 110 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 CCL25O15444 150 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 IGLC6P0CF74 106 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 Q6ZS46 218 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 C20orf173Q96LM9 149 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 A0A087WX48 190 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 HLA-DRB4P13762 266 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 CFHR3Q02985 330 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM101Q96IK0 257 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF292O60281 2723 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 PMVKQ15126 192 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 C20orf78Q9BR46 151 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 H3BRM9 83 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 HTN3P15516 51 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-206ENST00000368215 GAGE1Q13065 139 aa6.44□□□□□ -1.38
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