RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616566.4

PGM3-215, Transcript of phosphoglucomutase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene PGM3, Length 5,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGM3-215	ENST00000616566	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	WFDC2	Q14508	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		F8VRH5	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	DEFB1	P60022	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ZNF292	O60281	2723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		Q8N6K4	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	APOM	O95445	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	EMP1	P54849	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	LY6E	Q16553	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	IGF1	P05019	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		K7ENP7	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PF4V1	P10720	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	UBE2E1	P51965	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TACC2	O95359	2948 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CDSN	Q15517	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	NRAC	Q8N912	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		A6NJY4	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TCF15	Q12870	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	HERVK_113	P61574	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	EBI3	Q14213	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	AGRN	O00468	2067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		F6UB75	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SRD5A1	P18405	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	AZU1	P20160	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TAL2	Q16559	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		E9PLD3	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566		F8W1H4	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	NPFF	O15130	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SLC25A16	P16260	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	TGFA	P01135	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PRR9	Q5T870	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	OVOL1	O14753	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	PSMB2	P49721	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	GNRH2	O43555	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	KLRB1	Q12918	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	KALRN	O60229	2985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGM3-215	ENST00000616566	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms