RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MTW9 85 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BMM0 161 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 J3KRW8 73 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 MED14OSP0DP75 135 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 GZMBP10144 247 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMPP49913 170 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF747Q9BV97 191 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GXF2 115 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGC1P0CF51 173 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV3-20P01619 116 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLC6P0CF74 106 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB1P60022 68 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 GDF5OSQ5U4N7 250 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf56Q8N813 242 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 KNCNA6PVL3 124 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BKO60814 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BJP06899 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5AL1P0C617 328 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BOP23527 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BBP33778 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BDP58876 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BCP62807 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST2H2BEQ16778 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BHQ93079 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BNQ99877 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BMQ99879 126 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 TWIST1Q15672 202 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 DNLZQ5SXM8 178 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 INSP01308 110 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA6P56556 154 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ODF3L2Q3SX64 289 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR9Q5T870 116 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 GATD1Q8NB37 220 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 CNFNQ9BYD5 112 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 TDRG1Q3Y452 100 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 GFI1BQ5VTD9 330 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 AMTNQ6UX39 209 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R2Z0 102 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 PHOX2AO14813 284 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SNAI2O43623 268 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC21Q5SSG8 566 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT8Q8NBV8 401 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf21Q9P2W6 132 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 CD7P09564 240 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A2P29034 98 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10J3Q5JRS4 329 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf52A6NGY3 159 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BVH4 76 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 NTF3P20783 257 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 BAGE3Q86Y29 109 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 PPBPP02775 128 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 Q0VG73 95 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM208Q9BTX3 173 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 CBY3A6NI87 242 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2CO00762 179 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 SRIP30626 198 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 SLAQ13239 276 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA5P20719 270 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 AP1S3Q96PC3 154 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM17P0DL12 118 aa16.67■□□□□ 0.26
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