RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	RASL10A	Q92737	203 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	PGP	A6NDG6	321 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	SIVA1	O15304	175 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	MB	P02144	154 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	ORM1	P02763	201 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	CRYBA4	P53673	196 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	FHL2	Q14192	279 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301		Q5BKY6	102 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	WFDC1	Q9HC57	220 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301		G3V3Q6	166 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301		K7EQM0	130 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	NXPH4	O95158	308 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	SERF2	P84101	59 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	MUC21	Q5SSG8	566 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	AQP10	Q96PS8	301 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		C9JCJ5	164 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		M0R2P5	195 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	CIDEA	O60543	219 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	STAG3L2	P0CL84	134 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	STAG3L3	P0CL85	134 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	SRI	P30626	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00315	P59091	139 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	RAB2A	P61019	212 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		Q6ZQT7	251 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	SUN5	Q8TC36	379 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	MED28	Q9H204	178 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TIRAP	P58753	221 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	RYR1	P21817	5038 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		K7EQD1	137 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TAAR5	O14804	337 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	CXorf1	O96002	111 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TCRA	P04437	139 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	EVI2A	P22794	236 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	ATP6V0C	P27449	155 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	GCHFR	P30047	84 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	ERVFC1-1	P60608	527 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	ZFP69	Q49AA0	526 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	PTH2	Q96A98	100 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1W2PRE2	83 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301		F6UZH7	168 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	GNRH2	O43555	120 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	TYMS	P04818	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NPC1-208	ENST00000590301	SFTA3	P0C7M3	94 aa		5.18	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123 ms