RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.99□□□□□ -1.13
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CLSTN3-211ENST00000541667 F6UZH7 168 aa7.99□□□□□ -1.13
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R2P5 195 aa7.99□□□□□ -1.13
CLSTN3-211ENST00000541667 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.99□□□□□ -1.13
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CLSTN3-211ENST00000541667 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.99□□□□□ -1.13
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CLSTN3-211ENST00000541667 ERVFC1-1P60608 527 aa7.92□□□□□ -1.14
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CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.92□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.92□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 PRNTQ86SH4 94 aa7.92□□□□□ -1.14
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CLSTN3-211ENST00000541667 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.92□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 Q9UF83 564 aa7.92□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.91□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.91□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.91□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.91□□□□□ -1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 CIDEAO60543 219 aa7.91□□□□□ -1.14
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