RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495663.1

RAB11FIP3-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RAB11FIP3, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 B5MCH6 92 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CLLU1Q5K131 121 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PRR9Q5T870 116 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TVP23CQ96ET8 276 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NEU1Q99519 415 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MED9Q9NWA0 146 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 U3KQK5 164 aa7.31□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM250H0YL14 139 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 H7BYZ3 331 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LTAP01374 205 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MIFP14174 115 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TAS2R60P59551 318 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FOXI1Q12951 378 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMUG1Q53HV7 270 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q6AWC8 147 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC01587Q99440 93 aa7.3□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GCGP01275 180 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RRN3P1Q2M238 152 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CT83Q5H943 113 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DERL1Q9BUN8 251 aa7.29□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HTN1P15515 57 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PEA15Q15121 130 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BAGE2Q86Y30 109 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q8NAQ8 132 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TENM3Q9P273 2699 aa7.28□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM189A5PLL7 270 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GNG4P50150 75 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CEBPGP53567 150 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CENPWQ5EE01 88 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMIM12Q96EX1 92 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PARLQ9H300 379 aa7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A0A0J9YWU9 116 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RAB19A4D1S5 217 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CBY3A6NI87 242 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MUC21Q5SSG8 566 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q6ZQT7 251 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C16orf74Q96GX8 76 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 KCNS1Q96KK3 526 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NAGKQ9UJ70 344 aa7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C9JCJ5 164 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DEFB4AO15263 64 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PRM2P04554 102 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 AZU1P20160 251 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TDRG1Q3Y452 100 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 COX11Q9Y6N1 276 aa7.25□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF727A8MUV8 499 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SNURFLB1AK76 121 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SH2D1AO60880 128 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGLV2-8P01709 118 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CRIP1P50238 77 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 EMP1P54849 157 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PRR27Q6MZM9 219 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BIN3Q9NQY0 253 aa7.24□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.23□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.23□□□□□ -1.25
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C9JQL5 133 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms