RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 H7C1H1 209 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0BQ99437 205 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 BUB3O43684 328 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PPR1 153 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 OR11H12B2RN74 326 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 PRTN3P24158 256 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 OR11H1Q8NG94 326 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 OR11H2Q8NH07 326 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N6K4 173 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 MTURNQ8N3F0 131 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 MRAP2Q96G30 205 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 M0R1W7 72 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 INSL3P51460 131 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A16P16260 332 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TOMM6Q96B49 74 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 EBI3Q14213 229 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 C15orf32Q32M92 178 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 APOMO95445 188 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 OOSP1A8MZH6 123 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 H3BVH4 76 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC3BP05452 202 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 ATP5G2Q06055 141 aa11.4□□□□□ -0.58
TOP3B-206ENST00000436282 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 KLK15Q9H2R5 256 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 A6NJY4 79 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CKS1BP61024 79 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 FOXI1Q12951 378 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZQT7 251 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB2A2Q13296 93 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N9W7 124 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 C20orf78Q9BR46 151 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 KLK9Q2XQG4 91 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 BAALCQ8WXS3 180 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 RASL10AQ92737 203 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF815PA8K554 130 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2D1P51668 147 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 ECSCRQ19T08 205 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01549A6NIU2 74 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC140Q96MF4 163 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 METTL26Q96S19 204 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PRR9Q5T870 116 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SYT8Q8NBV8 401 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SPG11Q96JI7 2443 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 COX6B1P14854 86 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.35□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN13O95857 204 aa11.34□□□□□ -0.59
TOP3B-206ENST00000436282 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
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