RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZTI0 123 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 HYLS1Q96M11 299 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TCL1AP56279 114 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 GNG5P63218 68 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 SIVA1O15304 175 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 SPINK4O60575 86 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 ERVFC1-1P60608 527 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 STOML3Q8TAV4 291 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 EPDR1Q9UM22 224 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 A0A096LPF7 62 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 FAM74A7A6NL05 159 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 UMAD1C9J7I0 102 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TMUB2Q71RG4 321 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-204ENST00000403441 NXPH4O95158 308 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 C1QBP02746 253 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FHITP49789 147 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 HERC1Q15751 4861 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 RGS13O14921 159 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PAX4O43316 350 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 NFE4Q86UQ8 179 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TREM1Q9NP99 234 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PSG8Q9UQ74 426 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 K7EQM0 130 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 ZNF415Q09FC8 603 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FRZBQ92765 325 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 F6UZH7 168 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 MUC21Q5SSG8 566 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SGK494Q96LW2 274 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 C8orf49Q96NF6 230 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SPXQ9BT56 116 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 MDFICQ9P1T7 246 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PRO0255Q9UI72 69 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PEX7O00628 323 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PFDN1O60925 122 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-53P01767 116 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.063e-10■□□□□ 9.6
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PRAME-204ENST00000403441 SLAQ13239 276 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 Q5VSD8 79 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 Q86TA4 180 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 RASL10AQ92737 203 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 KCNS1Q96KK3 526 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 LINC00479Q96M42 142 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 GCGP01275 180 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TYMSP04818 313 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SMUG1Q53HV7 270 aa8.41□□□□□ -1.06
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