RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CNFNQ9BYD5 112 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.51□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GW15 77 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM189A5PLL7 270 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 A8MTW9 85 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 S100A8P05109 93 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CSN3P07498 182 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ESDP10768 282 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CTRLP40313 264 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ID1P41134 155 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PROK1P58294 105 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 HBBP68871 147 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 Q8N1Y9 231 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF738Q8NE65 137 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OR11H1Q8NG94 326 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ODF3Q96PU9 254 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CDIP1Q9H305 208 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.5□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GUT8 65 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 KLLNB2CW77 178 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SPINK4O60575 86 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 GZMBP10144 247 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CD28P10747 220 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SLAQ13239 276 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB136Q30KP8 78 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 DNLZQ5SXM8 178 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 DPF1Q92782 380 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 RAX2Q96IS3 184 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PEMTQ9UBM1 199 aa4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 HIVEP2P31629 2446 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 NOTCH2Q04721 2471 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0J9YX75 114 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 M0QZ24 198 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 APCSP02743 223 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 RIGQ13278 110 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PRR9Q5T870 116 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.48□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 INAFM1C9JVW0 142 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 F2Z2F3 143 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 F6UB75 175 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CCL24O00175 119 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SNAI2O43623 268 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 CRLF1O75462 422 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 AMBPP02760 352 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM6P0DI80 62 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PCP4P48539 62 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB1P60022 68 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 PAFAH1B2P68402 229 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 AMTNQ6UX39 209 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 U3KQK5 164 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 X6R8D5 127 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 MTORP42345 2549 aa4.47□□□□□ -1.69
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GUS0 222 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 H0Y8G0 127 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TCF21O43680 179 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 NUPR1O60356 82 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 ORM1P02763 201 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 OR5AL1P0C617 328 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF688P0C7X2 276 aa4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.2 ms