RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-218ENST00000617172 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.71□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TMED6Q8WW62 240 aa6.71□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.71□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.71□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 OTORQ9NRC9 128 aa6.71□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 DIRC3C9JPN6 131 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ZNF415Q09FC8 603 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 Q6AWC8 147 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 SPXQ9BT56 116 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MBD2Q9UBB5 411 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PRO0255Q9UI72 69 aa6.7□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 NACAE9PAV3 2078 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 A0A096LPF7 62 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PGPA6NDG6 321 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PAX4O43316 350 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TNP2Q05952 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PRR9Q5T870 116 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 Q8TAT8 98 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 HYLS1Q96M11 299 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.69□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TDRG1Q3Y452 100 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 RASL10AQ92737 203 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 WFDC1Q9HC57 220 aa6.68□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 C16orf90A8MZG2 172 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 SIVA1O15304 175 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MBP02144 154 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 CRYBA4P53673 196 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 FHL2Q14192 279 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MUC21Q5SSG8 566 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 Q6ZQT7 251 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ZNF575Q86XF7 245 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ASB13Q8WXK3 278 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MED28Q9H204 178 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ALG5Q9Y673 324 aa6.67□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 HERC2O95714 4834 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 K7EP13 123 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 K7EQM0 130 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PTTG1O95997 202 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 IGHV3-53P01767 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 ORM1P02763 201 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 SERF2P84101 59 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 KCNS1Q96KK3 526 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 TREM1Q9NP99 234 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 MDFICQ9P1T7 246 aa6.66□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 DNAH2Q9P225 4427 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 M0R2P5 195 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 CDK2AP2O75956 126 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 RAB2AP61019 212 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 C8orf49Q96NF6 230 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 AQP10Q96PS8 301 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.65□□□□□ -1.34
TARDBP-218ENST00000617172 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 C9JCJ5 164 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 CIDEAO60543 219 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 NXPH4O95158 308 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 STAG3L2P0CL84 134 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 STAG3L3P0CL85 134 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 SRIP30626 198 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 SUN5Q8TC36 379 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 RAB24Q969Q5 203 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.64□□□□□ -1.35
TARDBP-218ENST00000617172 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.64□□□□□ -1.35
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