RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLN2Q8IUK8 224 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 STAB1Q9NY15 2570 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP5P3A8MUU1 101 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 CRIP1P50238 77 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA3Q8NHX4 192 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPOP30536 169 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 LEPP41159 167 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 COL6A5A8TX70 2615 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BMM0 161 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTL10Q5JWF8 245 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 PFN1P07737 140 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 S100PP25815 95 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 IL36BQ9NZH7 164 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 GPX1P07203 203 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNIP4Q6PIL6 250 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 VWFP04275 2813 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 KNCNA6PVL3 124 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 KLLNB2CW77 178 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D1AO60880 128 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MWL6 223 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLL1P15814 213 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR31Q5SQ13 230 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 AMTNQ6UX39 209 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 NOTCH3Q9UM47 2321 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CD7P09564 240 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKN1BP46527 198 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6AWC8 147 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 GTSCR1Q86UQ5 136 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf73Q9NVV2 129 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV21A0A0B4J279 112 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM231BA6NCW3 169 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 STHQ8IWL8 128 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TSKUQ8WUA8 353 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 BTF3L4Q96K17 158 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 XKRY2A2RUG3 117 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2D3Q8NGH3 330 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 GFRA4Q9GZZ7 299 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS20P60866 119 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOBQ15370 118 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF124Q15973 351 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 YPEL4Q96NS1 127 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV3-20P01619 116 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01559Q495D7 138 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR9Q5T870 116 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM189A5PLL7 270 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf71A4D174 169 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 AMBPP02760 352 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-206ENST00000588815 J3KRW8 73 aa22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-206ENST00000588815 ORM1P02763 201 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL19P84098 196 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINK13Q1W4C9 94 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 PYGO2Q9BRQ0 406 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT8BQ9UHF3 227 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 COLCA2A8K830 154 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 MDFIQ99750 246 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R2Z0 102 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL1P09341 107 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPQ1 181 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 RIPPLY3P57055 190 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 GFI1BQ5VTD9 330 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 NEU1Q99519 415 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR3DS1Q14943 382 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf144Q9BQM9 153 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 HIGD1CA8MV81 97 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNS1Q96KK3 526 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf21Q9P2W6 132 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TCL1AP56279 114 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP35Q8NFH5 326 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GTSF1Q8WW33 167 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM210BQ96KR6 192 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CRXO43186 299 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC10AQ9H1F0 79 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TYMSP04818 313 aa22.79■■□□□ 1.24
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