RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q9H3A6 140 aa13.68□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXorf1O96002 111 aa13.67□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERCC8Q13216 396 aa13.67□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OTORQ9NRC9 128 aa13.67□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPG2P98160 4391 aa13.67□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C7orf71A4D174 169 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UMAD1C9J7I0 102 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NMBP08949 121 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP69Q49AA0 526 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBAKDNA6NC62 111 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPX1P07203 203 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FHITP49789 147 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF138P52744 262 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMED6Q8WW62 240 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATG101Q9BSB4 218 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.65□□□□□ -0.22
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.64□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRM2P04554 102 aa13.64□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC51BQ86UW2 128 aa13.64□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF575Q86XF7 245 aa13.64□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.64□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGPA6NDG6 321 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNURFLB1AK76 121 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB130BP0DP73 79 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB130AP0DP74 79 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRISP2P16562 243 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AZU1P20160 251 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VGLL1Q99990 258 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF492Q9P255 531 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NACAE9PAV3 2078 aa13.63□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLLNB2CW77 178 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIRC3C9JPN6 131 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIR3DS1Q14943 382 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.62□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PRE2 83 aa13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 F5H768 121 aa13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.61□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CBY3A6NI87 242 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GGTLC3B5MD39 225 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7EQM0 130 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGS13O14921 159 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTN1A1Q13410 526 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT3O95989 172 aa13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP5G1P05496 136 aa13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP5G3P48201 142 aa13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.59□□□□□ -0.23
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SULT1A2P50226 295 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB5CP51148 216 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL18P55774 89 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNP2Q05952 138 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf223Q8N319 242 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q8TAT8 98 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.58□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM74A7A6NL05 159 aa13.57□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.57□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.57□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.57□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa13.57□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf90A8MZG2 172 aa13.56□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCRAP04437 139 aa13.56□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.56□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.56□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.56□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.55□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.55□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNG5P63218 68 aa13.55□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPDR1Q9UM22 224 aa13.55□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.55□□□□□ -0.24
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.1 ms