RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 PRTN3P24158 256 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 OR11H1Q8NG94 326 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 OR11H2Q8NH07 326 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 SVILO95425 2214 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 A6NJY4 79 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 BUB3O43684 328 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 TRGV3P03979 118 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 NDPQ00604 133 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 ERCC8Q13216 396 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 HES1Q14469 280 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 PRAC2D3DTV9 90 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 GOSR1O95249 250 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 C20orf78Q9BR46 151 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 H3BMG7 143 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 TOMM6Q96B49 74 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 LINC01549A6NIU2 74 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 M0R381 172 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 ETDBQ3ZM63 59 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 MTURNQ8N3F0 131 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 IGHV3-23P01764 117 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 LYNX1P0DP58 116 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 MED14OSP0DP75 135 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 TIMD4Q96H15 378 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 VCX2Q9H322 139 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-202ENST00000542324 PPP1R17O96001 155 aa8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 KLRD1Q13241 179 aa8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 RAXQ9Y2V3 346 aa8.09□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 UBE2D1P51668 147 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 EFNA4P52798 201 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 U3KQE9 123 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 ABCA1O95477 2261 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 APOMO95445 188 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 RNF182Q8N6D2 247 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 METTL26Q96S19 204 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 TCF15Q12870 199 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 FOXI1Q12951 378 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 C15orf32Q32M92 178 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 Q8N9W7 124 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 CKS1BP61024 79 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 AMTNQ6UX39 209 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 BAALCQ8WXS3 180 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 AGRNO00468 2067 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-202ENST00000542324 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.05□□□□□ -1.12
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