RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.77□□□□□ -0.84
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHG3P01860 377 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 COX8AP10176 69 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 KIR2DL4Q99706 377 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 FOXE3Q13461 319 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 WFDC2Q14508 124 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PRAC2D3DTV9 90 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8N7P7 452 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 CEACAM4O75871 244 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf159Q96HA4 380 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP5LO75964 103 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PAX2Q02962 417 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 NCKAP5O14513 1909 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01549A6NIU2 74 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ASIPP42127 132 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB125Q8N687 156 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR25Q96S07 402 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV1-44P01699 117 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 HAX1O00165 279 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 HLA-DRB4P13762 266 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 GAS8-AS1O95177 125 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A16P16260 332 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 AZU1P20160 251 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 DTX2Q86UW9 622 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.75□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 A6NJY4 79 aa9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PTH2Q96A98 100 aa9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF883P0CG24 379 aa9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 LAGE3Q14657 143 aa9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 CSTL1Q9H114 145 aa9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PRX2 142 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf118A6NHY6 69 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP6V0E1O15342 81 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6AWC8 147 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 C3orf56Q8N813 242 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MRAP2Q96G30 205 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ITGB1BP1O14713 200 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 RS1O15537 224 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 GP9P14770 177 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP5J2P56134 94 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMG4Q5JS54 123 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TTC32Q5I0X7 151 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 RASL11AQ6T310 242 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PPM0 123 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 MBD6Q96DN6 1003 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 SPXQ9BT56 116 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM238C9JI98 176 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PRSS46E5RG02 174 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 CKS1BP61024 79 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 RBX1P62877 108 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 OVOL3O00110 214 aa9.71□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 SAA4P35542 130 aa9.71□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.71□□□□□ -0.85
TRIOBP-211ENST00000492485 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 F8P00451 2351 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 GNRH2O43555 120 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 CTRLP40313 264 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 SYT8Q8NBV8 401 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 CFHR4Q92496 578 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 DUX3Q96PT4 197 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.71□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.7□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3-53P01767 116 aa9.7□□□□□ -0.86
TRIOBP-211ENST00000492485 PAX8Q06710 450 aa9.7□□□□□ -0.86
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