RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 IL36BQ9NZH7 164 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 HELTA6NFD8 242 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00587B1AMM8 73 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 CORTO00230 105 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFB4O95168 129 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV1-47P01700 117 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-11P01762 117 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRK-211ENST00000429595 CD7P09564 240 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 C8orf88P0DMB2 117 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRK-211ENST00000429595 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 Q5VSD8 79 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 FAM78BQ5VT40 261 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRK-211ENST00000429595 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 PKHD1P08F94 4074 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPQ1 181 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS9O00182 355 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV2-23P01705 113 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 FABP4P15090 132 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 GNG4P50150 75 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRK-211ENST00000429595 RAB4BP61018 213 aa4.48□□□□□ -1.69
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