RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 COX11Q9Y6N1 276 aa11.92□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.92□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.92□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 ATP5G2Q06055 141 aa11.91□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.91□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 C2orf91Q6ZV80 131 aa11.91□□□□□ -0.5
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NISCH-202ENST00000420808 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.84□□□□□ -0.51
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NISCH-202ENST00000420808 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 TM4SF20Q53R12 229 aa11.83□□□□□ -0.52
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NISCH-202ENST00000420808 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 SORL1Q92673 2214 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 NRACQ8N912 160 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
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