RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 GATA4P43694 442 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 MORN5Q5VZ52 161 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 GPHA2Q96T91 129 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SHISA9B4DS77 424 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BQ85 93 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CD177Q8N6Q3 437 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 Q8TCH9 128 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF5Q99942 180 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RETNQ9HD89 108 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF292O60281 2723 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PSPNO60542 156 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SAP30O75446 220 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CD55P08174 381 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLL1P15814 213 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 HS3ST6Q96QI5 342 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3-23P01764 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CEND1Q8N111 149 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 YPEL4Q96NS1 127 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0U1RQV1 116 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf98A8MV24 154 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1D-12P01611 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CFHR2P36980 270 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C12orf74Q32Q52 190 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 NRGNQ92686 78 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 G3V4G9 280 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3-48P01763 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TFF3Q07654 80 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE6HQ13956 83 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00643Q86TS7 51 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 S4R3C0 116 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 H0YIZ8 118 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CFC1BP0CG36 223 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CFC1P0CG37 223 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2AP49459 152 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM141Q96I45 108 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 OVOL1O14753 267 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PIP4P2Q8N4L2 257 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF138Q8WVD3 245 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1B0GUS0 222 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFC1O43677 76 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV3-20P01619 116 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CD7P09564 240 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF876PQ49A33 203 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZR03 302 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZUT4 128 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF329Q86UD4 541 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109 ms