RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 YPEL4Q96NS1 127 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 SPANXCQ9NY87 97 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 HIGD1BQ9P298 99 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TSC2P49815 1807 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 MT-ATP8P03928 68 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 HTN3P15516 51 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 THAP8Q8NA92 274 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 GTSF1Q8WW33 167 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 I3L3M4 83 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 K7EM74 188 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZUT4 128 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-202ENST00000402738 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PFN2P35080 140 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 LINC01620Q4KN68 170 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PLXNA3P51805 1871 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 A4D1N5 150 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ZNF415Q09FC8 603 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 SHISA9B4DS77 424 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 C22orf46C9J442 243 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 INSP01308 110 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GX51 115 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PEMTQ9UBM1 199 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 VWA8A3KMH1 1905 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PRX2 142 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ACYP1P07311 99 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 WDR90Q96KV7 1748 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 SPRY2O43597 315 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 POU2AF1Q16633 256 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 M0R1W7 72 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 CTRLP40313 264 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 TMEM258P61165 79 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 TMEM243Q9BU79 118 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 CFHR4Q92496 578 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ATOX1O00244 68 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 THBDP07204 575 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 MGAMO43451 1857 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 OVOL3O00110 214 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 CRLF1O75462 422 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PRB1P04280 392 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PATE2Q6UY27 113 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 LTBRP36941 435 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 CCL19Q99731 98 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 OOSP1A8MZH6 123 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 GP9P14770 177 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 ODF1Q14990 250 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PROK2Q9HC23 129 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 A0A0B4J2C4 111 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 FOXE3Q13461 319 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-202ENST00000402738 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.72□□□□□ -1.17
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