RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr1256Q8VGP1 306 aa11.93□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gatad1Q920S3 266 aa11.93□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zfp236S4R299 1847 aa11.93□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 OdamA1E960 273 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CirbpP60824 172 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ly96Q9JHF9 160 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Phxr1P15973 60 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vstm2lQ6PDS0 220 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 RpeQ8VEE0 228 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dock1Q8BUR4 1865 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Defa-rs2P17534 91 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trav15-1-dv6-1Q5R1D2 117 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GfralQ6SJE0 393 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam117aQ7TNF9 451 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Necap2Q9D1J1 266 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lyzl6Q9DA11 148 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gpa33Q9JKA5 319 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trpm6Q8CIR4 2028 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dicer1Q8R418 1916 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnfaip6O08859 275 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MymxQ2Q5T5 84 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc25a35Q5SWT3 300 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SowahbQ8BZW2 760 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Myct1Q8R411 188 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fmc1Q9CR13 113 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa11.92□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ripply2Q2WG76 128 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tex52Q3TTI8 308 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prickle3Q80VL3 624 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abhd17aQ99JW1 310 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ssbp1Q9CYR0 152 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 St6galnac6Q9JM95 333 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr1382Q7TQT3 311 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Alkbh6Q8K2U2 238 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem186Q9CR76 216 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Coa3Q9D2R6 108 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm21775J3KMK6 180 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zcwpw2Q08EN7 125 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sfxn3Q91V61 321 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 P01795 144 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tcl1b1P56840 116 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Otx1P80205 355 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 2210407C18RikQ6YI28 220 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr1333Q7TQV7 317 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem177Q8BPE4 311 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cox19Q8K0C8 92 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nabp2Q8R2Y9 212 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr498Q8VEW2 330 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ube2cQ9D1C1 179 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnase4Q9JJH1 148 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plxna1P70206 1894 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ankrd12G5E893 2041 aa11.91□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Defa7P50705 93 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trav8n-2A0A075B633 112 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trav6d-5A0A075B6B9 112 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm21719J3KMI9 230 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 LtbP41155 306 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prss38Q3UKY7 322 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ms4a13Q5FWC3 203 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc35e4Q8K3D6 351 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SostQ99P68 211 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trem3Q9JKE1 183 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Taf1Q80UV9 1891 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr753-ps1A0A140LHN3 164 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm21616B6ZB74 166 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm6594J3QM43 95 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm10097J3KMK7 105 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dynlt3P56387 116 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmed6Q9CQG0 239 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem160Q9D938 188 aa11.9□□□□□ -0.5
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm4788E9Q8B5 879 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dll3O88516 592 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem230Q8CIB6 120 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrpl33Q9CQP0 65 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 4933402D24RikQ9D4D3 167 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccl8Q9Z121 97 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sh2d1bO35324 132 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cep290Q6A078 2472 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Smad4P97471 551 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr981Q8VEU2 310 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rpp25Q91WE3 199 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klri1B2KG20 248 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 OstcQ78XF5 149 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem108Q8BHE4 574 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vopp1Q8R1C3 172 aa11.89□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccl17F6R5P4 103 aa11.88□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cd69P37217 199 aa11.88□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr433Q7TRV9 314 aa11.88□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nanos1Q80WY3 267 aa11.88□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm5111Q8C9M4 190 aa11.88□□□□□ -0.51
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm42957D6RFQ2 366 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.6 ms