Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Dll3O88516 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Dll3O88516 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Dll3O88516 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Dll3O88516 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Dll3O88516 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Dll3O88516 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dll3O88516 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dll3O88516 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dll3O88516 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dll3O88516 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Dll3O88516 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Dll3O88516 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Dll3O88516 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Dll3O88516 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Dll3O88516 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Dll3O88516 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Dll3O88516 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Dll3O88516 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Dll3O88516 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Dll3O88516 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Dll3O88516 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Dll3O88516 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Dll3O88516 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Dll3O88516 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Dll3O88516 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Dll3O88516 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Dll3O88516 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dll3O88516 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dll3O88516 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dll3O88516 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dll3O88516 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Dll3O88516 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dll3O88516 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dll3O88516 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dll3O88516 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Dll3O88516 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Dll3O88516 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dll3O88516 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dll3O88516 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Dll3O88516 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dll3O88516 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dll3O88516 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dll3O88516 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dll3O88516 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Dll3O88516 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dll3O88516 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Dll3O88516 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dll3O88516 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dll3O88516 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dll3O88516 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Dll3O88516 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dll3O88516 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dll3O88516 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dll3O88516 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dll3O88516 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dll3O88516 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dll3O88516 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dll3O88516 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dll3O88516 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Dll3O88516 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dll3O88516 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Dll3O88516 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dll3O88516 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dll3O88516 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dll3O88516 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dll3O88516 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dll3O88516 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dll3O88516 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dll3O88516 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dll3O88516 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dll3O88516 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dll3O88516 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dll3O88516 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dll3O88516 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dll3O88516 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dll3O88516 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dll3O88516 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dll3O88516 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dll3O88516 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dll3O88516 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dll3O88516 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Dll3O88516 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dll3O88516 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dll3O88516 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dll3O88516 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dll3O88516 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Dll3O88516 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dll3O88516 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dll3O88516 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Dll3O88516 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dll3O88516 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dll3O88516 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dll3O88516 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dll3O88516 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dll3O88516 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dll3O88516 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dll3O88516 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dll3O88516 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dll3O88516 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms