Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LtbP41155 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LtbP41155 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LtbP41155 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtbP41155 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LtbP41155 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LtbP41155 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LtbP41155 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LtbP41155 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LtbP41155 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LtbP41155 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LtbP41155 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LtbP41155 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LtbP41155 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LtbP41155 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LtbP41155 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LtbP41155 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LtbP41155 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LtbP41155 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LtbP41155 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LtbP41155 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LtbP41155 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LtbP41155 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LtbP41155 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LtbP41155 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LtbP41155 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LtbP41155 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LtbP41155 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LtbP41155 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LtbP41155 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbP41155 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LtbP41155 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LtbP41155 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbP41155 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbP41155 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbP41155 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbP41155 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LtbP41155 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LtbP41155 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LtbP41155 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LtbP41155 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LtbP41155 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbP41155 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LtbP41155 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbP41155 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LtbP41155 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LtbP41155 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LtbP41155 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LtbP41155 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbP41155 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbP41155 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbP41155 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbP41155 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LtbP41155 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbP41155 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbP41155 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbP41155 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LtbP41155 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LtbP41155 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LtbP41155 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LtbP41155 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LtbP41155 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbP41155 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LtbP41155 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LtbP41155 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LtbP41155 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbP41155 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbP41155 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LtbP41155 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LtbP41155 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LtbP41155 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LtbP41155 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LtbP41155 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbP41155 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbP41155 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LtbP41155 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LtbP41155 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LtbP41155 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbP41155 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LtbP41155 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LtbP41155 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LtbP41155 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LtbP41155 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbP41155 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbP41155 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbP41155 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LtbP41155 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LtbP41155 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbP41155 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbP41155 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbP41155 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LtbP41155 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LtbP41155 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LtbP41155 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LtbP41155 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbP41155 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LtbP41155 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LtbP41155 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbP41155 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LtbP41155 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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