RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614478.1

GEN1-208, Transcript of GEN1, Holliday junction 5' flap endonuclease, human

Gene GEN1, Length 1,864 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GEN1-208	ENST00000614478	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	EDN2	P20800	178 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478		A8MWL6	223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	LGALS9	O00182	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478		P01737	135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	ASCL2	Q99929	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478		A8MWP6	167 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	NDUFA7	O95182	113 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	VGLL1	Q99990	258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	LINC01619	G3V211	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	S100A2	P29034	98 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	BMI1	P35226	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SLURP1	P55000	103 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	SOCS3	O14543	225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	CBLN1	P23435	193 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	TCL1A	P56279	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	DPF1	Q92782	380 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	IFITM10	A6NMD0	228 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	CD28	P10747	220 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	NEU1	Q99519	415 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GEN1-208	ENST00000614478	HAX1	O00165	279 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	C8orf49	Q96NF6	230 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	ERCC8	Q13216	396 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478		Q8TAT8	98 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	PRR25	Q96S07	402 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	C12orf57	Q99622	126 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478		A0A1B0GUS0	222 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	CRIP1	P50238	77 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478		A0A1B0GXF2	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GEN1-208	ENST00000614478		A0A1W2PRX2	142 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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