RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa17.08■□□□□ 0.32
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PTPRM-211ENST00000580170 LGALS9CQ6DKI2 356 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF524Q96C55 264 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRM-211ENST00000580170 K7ERJ3 54 aa17.08■□□□□ 0.32
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PTPRM-211ENST00000580170 RTTNQ86VV8 2226 aa17.07■□□□□ 0.32
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PTPRM-211ENST00000580170 H3BRN7 92 aa17.06■□□□□ 0.32
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PTPRM-211ENST00000580170 PRO1854Q9UHT4 67 aa17.04■□□□□ 0.32
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PTPRM-211ENST00000580170 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRM-211ENST00000580170 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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PTPRM-211ENST00000580170 RBM3P98179 157 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 RNF114Q9Y508 228 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA4O00483 81 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 CRYBA4P53673 196 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DMBP28068 263 aa16.97■□□□□ 0.31
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