RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511429.1

PAM-222, Transcript of peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase, human

TSL 3

Gene PAM, Length 880 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAM-222	ENST00000511429	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	OR11H1	Q8NG94	326 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	DPF1	Q92782	380 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	FAM210B	Q96KR6	192 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SGK494	Q96LW2	274 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		A0A1B0GUS0	222 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	C2orf70	A6NJV1	201 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		M0QZ24	198 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	OVOL1	O14753	267 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CD28	P10747	220 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	HLA-DMB	P28068	263 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ID1	P41134	155 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	PROK1	P58294	105 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	FHL3	Q13643	280 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TCF24	Q7RTU0	167 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	PRR25	Q96S07	402 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZFHX3	Q15911	3703 aa		5	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		A8MWL6	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		P01737	135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CSN3	P07498	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZNF138	P52744	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SLURP1	P55000	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	VGLL1	Q99990	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429		K7EQG2	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CCL24	O00175	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	EDN2	P20800	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CRIP1	P50238	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	RAB5B	P61020	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ERCC8	Q13216	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	COX19	Q49B96	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAM-222	ENST00000511429	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms